Spot Counter plugin tool
Histogramm plugin tool
Local Filter plugin tool
Marker Counting plugin tool
Annotation Creation plugin tool
Annotation Handling plugin tool
Selection plugin tool
Color Mapping plugin tool
Color Handling plugin tool
Dragging plugin tool
Zoom/Plane plugin tool
Navigator plugin tool
Imaris connector plugin tool
Projection plugin tool
Volume renderer plugin tool

Spot Counter plugin tool
Dieses Plugin zählt und markiert spots. Durch die Angabe des Größenbereichs sowie eines Rundheitsfaktors der Spots lässt es sich zur automatischen Zählung unterschiedlicher Spots einsetzen. Der Anwender kann nach dem Zählvorgang interaktiv markierte Spots aus dem Ergebnis entfernen und nicht erkannte Spots hinzufügen. Die Ergebnisse können direkt im Bild dokumentiert und als Bitmap abgespeichert werden.

Version: 1.0.0.1
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Histogramm plugin tool
Mit diesem Plugin lässt sich ein Histogramm ausgewählter Bereiche, ganzer Planes oder des gesamten Datensatzes bezüglich beliebiger Kanäle berechnen. Das resultierende Histogramm kann entweder die Intensitäten eines oder mehrerer Kanäle oder das Mapping eines Kanals bezüglich des RGB-Mappings anzeigen.

Version: 1.1.1.381
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Local Filter plugin tool
Mit diesem Plugin-Modul lassen sich unterschiedliche lokale Filter auf Datensätze anwenden. Filter können sowohl auf den gesamten Datensatz als auch einzelne Planes, Kanäle oder selektierte Bereiche angewendet werden. Veränderungen durch lokale Filter lassen sich jederzeit rückgängig machen, wenn der gefilterte Bereich im Rahmen der gewählten Größe des Undo-Buffers liegt.

Version: 1.1.0.173
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Marker Counting plugin tool
Dieses Plugin-Modul erlaubt ein einfaches Einfügen und automatisches Zählen von Markierungen. Damit lassen sich einfach umfangreiche Zählungen von Objekten durchführen. Im Paket enthalten ist eine Sammlung von ca. 20 verschiedenen Marker-Annotationen.

Version: 1.0.3.154
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Annotation Creation plugin tool
Mit diesem Modul lassen sich Annotation interaktiv erstellen. Insbesondere wird die einfache Erstellung mehrerer Annotationen nacheinander und die intuitive Arbeit mit Multiple Annotations unterstützt.

Version: 1.0.0.11
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Annotation Handling plugin tool
Dieses Modul gibt dem Anwender kompletten Zugang zu den Eigenschaften aller aktiven Annotationen. Mit Hilfe einer Baumansicht können diese Eigenschaften detailliert modifiziert werden. Während andere Module nur bestimmte Operationen auf speziellen Annotationen durchführen können (Segmentierer, Marker counting), hat man mit diesem Modul alle Annotationen unter voller Kontrolle.

Version: 1.4.2.109
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Selection plugin tool
Das Selection tool ist das Default-Plugin für den arivis Browser. Es ermöglicht die Auswahl und interaktive Manipulation von Annotationen sowie die Bewegung innerhalb der aktuellen Plane.

Version: 1.1.0.48
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Color Mapping plugin tool
Während das Color Handling tool eine sehr flexible Anpassung der Einfärbung von Kanalintensitäten gestattet, ist dieses Plugin für das sehr schnelle und intuitive Mapping von Farbtemplates auf die Daten gedacht. Für jeden Kanal stehen beliebige Kombinationen aus Farbe und Template zur Verfügung.

Version: 1.1.0.107
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Color Handling plugin tool
Der arivis Browser stellt umfangreiche Möglichkeiten bereit, die Anzeige der Intensitäten von Aufnahmen mit Hilfe von Lookup-Tabellen zu modifizieren. Diese Modifikationen wirken dabei nur auf die Anzeige und werden in Echtzeit durchgeführt. Das Color Handler-Modul bietet Schnittstellen für diese Funktionen an. Es stellt Dialoge zur Einstellung von Adjusts (Helligkeit, Kontrast, Gamma, Threshold) für den gesamten Datensatz oder einzelne Kanäle einer Schicht bereit. Mit zusätzlichen Dialogen kann man die auf die eigentlichen Lookup-Tabellen zugreifen und diese so sehr detailliert verändern.

Version: 1.3.4.85
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Dragging plugin tool
Dieses Modul stellt ein Werkzeug bereit, mit dem man sich mittels "Click and Drag" interaktiv innerhalb einer Plane bewegen kann.

Version: 1.1.3.10
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Zoom/Plane plugin tool
Dieses Modul liefert dem Anwender eine Oberfläche, um aktuelle Schicht (Plane) und Zoom-Stufe frei zu wählen. Darüber hinaus stellt es Shortcuts für häufig benutzte Zoomstufen (100%, ganze Plane in Fenster einpassen) zur Verfügung.

Version: 1.4.6.97
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Navigator plugin tool
Dieses Plugin-Modul stellt eine Miniaturansicht der aktuellen Plane dar. Es erlaubt eine intuitive Bewegung des sichtbaren Ausschnitts innerhalb der Plane sowie mit Hilfe eines Sliders die Navigation durch Planes.

Version: 1.5.3.98
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Imaris connector plugin tool
In Zusammenarbeit mit der Bitplane AG wurde ein Connector zum Visualisierungssystem Imaris implementiert. Damit können Ausschnitte aus sehr großen Bilddaten auch in Imaris gerendert werden.

Version: 1.0.0.1
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Projection plugin tool
Dieses Modul ermöglicht Max-Intensity-Projektionen entlang der Hauptachsen in den Datensätzen. Dabei ist das zu projizierende Subvolumen im Datensatz frei wählbar. Mit Hilfe interaktiver Werkzeuge kann das Volumen intuitiv ausgewählt werden.

Version: 1.0.0.55
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Volume renderer plugin tool
Mit diesem Plugin modul lassen sich Strukturen wie Bildstapel dreidimensional darstellen. Dabei werden die aktuellen Farbeinstellungen übernommen. Bei großen Strukturen erfolgt ein Level Of Detail Rendering. Damit werden alle Strukturen immer genau so fein aufgelöst dargestellt, wie es notwendig ist.

Version: 1.1.2.132
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