Pathologie/Neuropathologie

arivis Browser

Workflow zur Proteinspot Analyse- für automatisierte Detektion, Klassifizierung und Analyse von ß-Amyloid und dessen Ablagerungen auf digitalen Slides

Lösung für Grundlagenforschung an Alzheimer Demenz

Einige pathogenetische Mechanismen, die bei der Alzheimer Demenz ablaufen, sind Wissenschaftlern bekannt. Die eigentlichen Ursachen dieser häufigsten aller neurodegenerativen Erkrankungen und die Möglichkeiten ihrer Behandlung sind allerdings noch immer Gegenstand intensiver Grundlagenforschung.
Prof. Dr. Dr. Jens Pahnke, Leiter des Neurodegeneration Research Lab (NRL) Rostock und Mitglied des Deutschen Zentrums für Neurodegenerative Erkrankungen (DZNE), beschäftigt sich mit der Analyse von Faktoren, die zur Ausprägung einer sporadischen Alzheimer Demenz führen. Er suchte mit seinem Wissenschaftlerteam nach Möglichkeiten, die abgelagerten Proteine aus dem Gehirn zu lösen und abzutransportieren. Er fand heraus, dass diese Möglichkeit durch bestimmte Transportproteine übernommen werden kann.
Für die Auswertung seiner biologischen Untersuchungen verwendet Prof. Dr. Dr. Pahnke digitalisierte hochaufgelöste und somit enorm große Bilder der Präparate, deren Vollbilddarstellung und gleichzeitige Analyse bisher durch keine Imaging-Software ohne Restriktion bewältigt werden konnte.

Die Aufgabe für arivis bestand darin, schnellstmöglich eine Lösung zu schaffen, die es den Mitarbeitern des NRL ermöglicht, selbst auf größten Bilddaten eine schnelle, automatisierte Objekterkennung und -detektion, Quantifizierung, Klassifizierung und Analyse verschieden gefärbter Alzheimer-relevanter Proteine und den daraus resultierenden Ablagerungen durchzuführen.

Für die Applikation und die Problemstellung von Prof. Dr. Dr. Jens Pahnke konnten wir innerhalb kürzester Zeit die Lösung als integrierten Workflow in den arivis Browser bieten.

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arivis WebView

zur Visualisierung, Bearbeitung, Präsentation digitaler Slides in online-Lehrplattform

Lösung für e-learning in pathologischen Lehreinrichtungen

Die Möglichkeit, unbegrenzt große Bilddaten über Internet/Intranet zu visualisieren und gleichzeitig im Kontext zum Lehrinhalt didaktisch zu bearbeiten und zu präsentieren steht im Mittelpunkt des Interesses vieler Lehreinrichtungen der Pathologie.

Das Ziel der online-Lehrplattform mirax@net-base, einem Gemeinschaftsprojekt von arivis, Net-Base Computer und Netzwerktechnik e.K. und mit Unterstützung der Carl Zeiss MicroImaging GmbH, ist, das konventionelle System des zeit-und ortgebundenen Lernens in universitären Lehreinrichtungen der Pathologie durch eine moderne zeitgemäße Lehre mit Hilfe einer e-learning Anwendung abzulösen.
Die online-Lehrplattform soll das Lernen eines der anerkannt schwierigsten und vor allem umfangreichsten Fächer der medizinischen Ausbildung auf eine völlig neue Weise als selbstgesteuertes Lernen ermöglichen.
mirax@net-base basiert auf der Nutzung digitaler Slides, die mit dem arivis Webview in den Vorlesungen und beim Selbststudium visualisiert, bearbeitet und präsentiert werden.

Die hochperformante Visualisierung, Bearbeitung, Annotation und Präsentation dieser Bilddaten mit dem arivis WebView ist Kernstück der online-Anwendung.

Für die Applikation konnten wir mit unserem Know-How und unserer Basistechnologie in diesem Projekt diese Lösung bieten:

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