arivis erhält Auftrag vom MDC Berlin

arivis erhält vom MDC Berlin, AG Proteomics, Prof. Erich Wanker den Auftrag, ein auf Hochdurchsatzscreening (HTS) ausgerichtetes, hocheffizientes, automatisches Bildaufnahme- und Bildanalysetool zur Ermittlung von Y2H Protein-Protein-Interaktionen zu entwickeln.

Der arivis Browser stellt als modulare und erweiterbare Software die Basis für die Implementierung des Workflows "Yeast Analysis" dar.
Ziel der Entwicklung ist es, die manuelle Aufnahme und Analyse von Kulturplatten mit Hefekolonien als auch von Membranen mit den Interaktionskontrollen durch eine automatische Analyse im Stapelverarbeitungsmodus zu ersetzen.
Der erste Schritt der Entwicklung sieht einen automatischen Workflow sowohl für 96er als auch 384er Wellplatten (Agar/Membran) vor und umfaßt die Plattenerkennung, das Hinzufügen eines visuellen Grids, die Einteilung in Größen- und Intensitätsklassen, deren automatische Analyse und der Export der Ergebnisse nach Excel vor.
Der zweite Schritt der Entwicklung sieht die Erweiterung und Evaluierung des Workflows dann für 1536er Wellplatten (Agar/Membran) vor, dessen vollautomatisierte Bildanalyse die Basis für den vom MDC Berlin zukünftig angestrebten hohen Plattendurchsatz ist.
Der Workflow "Yeast Analysis" ist im arivis Browser implementiert und stellt somit dem Nutzer auch sämtliche Funktionalitäten des arivis Browser zur Verfügung.