AUFBRUCH IN UNGEAHNTE DIMENSIONEN

Der arivis Browser ist unsere Standardsoftware für komplexes Arbeiten mit mehrkanaligen 2D-, 3D- und 4D- (3D über die Zeit) Bilddaten aus der Mikroskopie von nahezu unbeschränkter Größe und unterschiedlichster Herkunft.

Die Möglichkeit, aufgenommene Bilddaten umfassend und ohne Verlust von Detailinformationen sowie in Echtzeit zu visualisieren und zu untersuchen, machen den arivis Browser für Wissenschaftler der Life Science, der Zellbiologie, der Pharmakologie, der Histologie und Pathologie, der Anatomie und verwandten Forschungsgebieten unentbehrlich.

Der arivis Browser ist eine hochleistungsfähige und adaptive Bildverarbeitungs- und Analysesoftware, die den Anwender ab Akquisition vom Gerät (Mikroskop, Scanner, Kamera) bis hin zur Präsentation des Experiments zuverlässig unterstützt.

Unser speziell entwickeltes Datenformat ist die Basis für den intelligenten Umgang mit Bilddaten bis zu ca. 500 Gbyte, einer Bildauflösung bis zu 2³¹ x 2³¹ Pixeln und einer räumlichen Darstellung mit bis zu 5 Dimensionen (x, y, z, t, beliebige Anzahl spektrale Kanäle).

Ein breites Spektrum leistungsfähiger Visualisierungstechniken, ein umfassendes Farbmanagementsystem, kanalbasiertes Arbeiten, hochqualitatives 3D- und 4D-Rendering und ein mächtiges Analysetool bedienen hervorragend die hohen Anforderungen der biomedizinischen Forschung und machen den arivis Browser zur Standardsoftware für große Bilddaten.

Beispiele für Applikationen

Life Science

• 4D-Visualisierung physiologischer Vorgänge in Langzeitexperimenten mit biologischen Lebendzellproben (Zell-, Gewebe und Embryokulturen)
• Echtzeit-Beobachtung von Wachstumsprozessen in Zellen oder Zellverbänden und Präsentation als Movie
• Zellbewegungsanalyse zur Untersuchung der Eliminierung pathogener Zellen

Zellbiologie/Neurobiologie/Pharmakologie

• FRET: Protein-Protein-Interaktionsmessung in Echtzeit (Fluorescence resonance energy transfer))
• FRAP: zeitaufgelöste Messung von Fluoreszenzintensitäten an einem bestimmten Ort
• RATIO: ratiometrische Messung und Visualisierung von Ionenkonzentrationen in lebenden Zellen über die Zeit
• konfokale Bildgebung: 3D-Visualisierung und Analyse subzellulärer Strukturen und Ca2+-Signalling
• Visualisierung der Entstehung und Bewegungsanalyse des Wachstums von Neuronen und neuronaler Verbindungen

Pathologie/Neuropathologie

• Lösung für Visualisierung, Objektdetektion und Analyse pathologischer und histopathologischer Vollbildaufnahmen vom Mikroskop oder Digital Slide Scanner

Anatomie/Neuroanatomie

• Image Fusion und 3D-Visualisierung morphologischer Untersuchungen anhand von HREM-Aufnahmen (High Resolution Episcopic Microscopy)

applikationsspezifische Anpassungen

Die modulare Architektur unserer Software bietet dem Anwender eine hohe Funktionalität durch Nutzung bereits verfügbarer Module.
Für anspruchsvolle Anwendungen wird der arivis Browser mithilfe von Plugins, Workflows oder durch Skripte massgeschneidert der Applikation angepasst oder um diese erweitert.
Schnell und effizient lassen sich so z.B. neue Import-oder Exportformate implementieren, existierende Geräte (Mikroskope, motorisierte Kreuztische, Kameras) ansteuern, spezielle Algorithmen zur Analyse evaluieren oder auch individuelle Visualisierungsformen anpassen.

Als fairer Partner der Wissenschaftler stellen wir unsere umfassende, durchdachte, erprobte und permanent weiterentwickelte API jedem Anwender frei zur Verfügung (Plugin-SDK). Auch wir bei arivis verwenden diese API, um die Funktionen für den arivis Browser weiter zu optimieren.