Release Notes: arivis Browser 2.4.0

Version Date: 2009, Nov

Main Features

• 4D Viewer: Visualisieren im Live-Modus (4D)
• 4D Viewer: Kanalbasiertes Mischen
• Analyse Pipeline: Interaktives Erstellen und Durchführen einer Analyse
• Well Plate Viewer: Multi-Well Aufnahmen

Neue Features und Funktionalitäten

• Neu: Visualisieren von Bildstapeln als 3D-Film über die Zeit im Live-Modus (4D) mit 4D-Viewer
• Neu: Stereographische 4D Darstellung
• Neu: mehrere Datensätze in einem File möglich (Scopes), z.B. für Multi-Well Experimente
• Neu: Kanalbasiertes Mischen von verschiedenen 3D-Visualisierungs-Techniken (z.B. Iso Surface und Volume Rendering)
• Neu: Übersichts-Darstellung von Multi-Well Aufnahmen mit Well Plate Viewer
• Neu: Nutzung unterschiedlicher Farbverläufe (Presets oder Nutzer-definiert) für die verschiedenen spektralen Kanäle
• Neu: Colorbar (linear oder logarithmisch) für Überblick über die eingestellten Farbverläufe der einzelnen Kanäle
• Neu: Einfache Übernahme von existierenden Daten durch Drag & Drop oder einen interaktiven Import-Wizard
• Neu: Import von biologischen Bildformaten wie TIFF, OME-TIFF, Zeiss LSM, Metamorph STK, ZVI Zeiss, Leica LEI, Imaris, TILLvisION, …
• Neu: Messen von Entfernungen und Flächen
• Neu: Zauberstab (Magic Wand Tool) für eine intensitätsbasierte ROI Auswahl
• Neu: Interaktives Erstellen und Durchführen einer Analyse mit einer Analyse Pipeline (Technology Preview)
• Neu: Nutzer-definierte Keyboard-Shortcuts

• Neu: Komplexe Abläufe über das leistungsfähige eingebaute Python-Scripting automatisieren

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  Mit Hilfe eines Import Wizards können Bilddaten über das Hauptmenü (Datei-->Importieren) oder per Drag & Drop auf ein offenes arivis Browser Fenster importiert werden. Der Anwender wird sowohl bei der Übernahme von einfachen als auch von komplexen mehrdimensionaligen Bilddaten schrittweise durch den Import-Prozess geführt.

  Der Analyse Wizard (Technology Preview) bietet eine einfache click-and-play Lösung zur quantitativen Analyse der Daten. Verschiedene Auswahl-und Filtermethoden können frei kombiniert werden und direkt auf den Bilddaten oder auf bereits analysierten Ergebnissen angewendet werden.Selbstdefinierte Analysen werden sofort berechnet und visualisiert und können zur weiteren Bearbeitung in anderen Anwendungen exportiert werden.

  Der Well Plate Viewer gibt einen Überblick über das gesamte Well Plate, das während der Aufnahme der Daten verwendet wird. Wells, die aufgezeichnete Daten enthalten, werden als entsprechendes Vorschaubild angezeigt. Jedes Well kann einen vollständigen multidimensionalen Bildstapel enthalten. Jeder dieser Bildstapel wird als ein einzelner Scope der SIS-Datei gespeichert.

  Der 4D-Viewer zeigt ein 3-dimensionales Volumen von Bilddaten über die Zeit. Für jeden Zeitpunkt wird ein einzelnes Volumen berechnet, mit Hilfe des Frame Navigation Tool oder der Navigator Palette kann durch das entsprechende Volumen navigiert werden. Zeitgleich kann sowohl ein intertaktiver 3D-Film über den integrierten Movieplayer abgespielt als auch innerhalb des Views navigiert werden.